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# -*- coding: utf-8 -*- 

""" 

    pygments.lexers.modeling 

    ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 

 

    Lexers for modeling languages. 

 

    :copyright: Copyright 2006-2014 by the Pygments team, see AUTHORS. 

    :license: BSD, see LICENSE for details. 

""" 

 

import re 

 

from pygments.lexer import RegexLexer, include, bygroups, using, default 

from pygments.token import Text, Comment, Operator, Keyword, Name, String, \ 

    Number, Punctuation 

 

from pygments.lexers.html import HtmlLexer 

from pygments.lexers import _stan_builtins 

 

__all__ = ['ModelicaLexer', 'BugsLexer', 'JagsLexer', 'StanLexer'] 

 

 

class ModelicaLexer(RegexLexer): 

    """ 

    For `Modelica <http://www.modelica.org/>`_ source code. 

 

    .. versionadded:: 1.1 

    """ 

    name = 'Modelica' 

    aliases = ['modelica'] 

    filenames = ['*.mo'] 

    mimetypes = ['text/x-modelica'] 

 

    flags = re.DOTALL | re.MULTILINE 

 

    _name = r"(?:'(?:[^\\']|\\.)+'|[a-zA-Z_]\w*)" 

 

    tokens = { 

        'whitespace': [ 

            (u'[\\s\ufeff]+', Text), 

            (r'//[^\n]*\n?', Comment.Single), 

            (r'/\*.*?\*/', Comment.Multiline) 

        ], 

        'root': [ 

            include('whitespace'), 

            (r'"', String.Double, 'string'), 

            (r'[()\[\]{},;]+', Punctuation), 

            (r'\.?[*^/+-]|\.|<>|[<>:=]=?', Operator), 

            (r'\d+(\.?\d*[eE][-+]?\d+|\.\d*)', Number.Float), 

            (r'\d+', Number.Integer), 

            (r'(abs|acos|actualStream|array|asin|assert|AssertionLevel|atan|' 

             r'atan2|backSample|Boolean|cardinality|cat|ceil|change|Clock|' 

             r'Connections|cos|cosh|cross|delay|diagonal|div|edge|exp|' 

             r'ExternalObject|fill|floor|getInstanceName|hold|homotopy|' 

             r'identity|inStream|integer|Integer|interval|inverse|isPresent|' 

             r'linspace|log|log10|matrix|max|min|mod|ndims|noClock|noEvent|' 

             r'ones|outerProduct|pre|previous|product|Real|reinit|rem|rooted|' 

             r'sample|scalar|semiLinear|shiftSample|sign|sin|sinh|size|skew|' 

             r'smooth|spatialDistribution|sqrt|StateSelect|String|subSample|' 

             r'sum|superSample|symmetric|tan|tanh|terminal|terminate|time|' 

             r'transpose|vector|zeros)\b', Name.Builtin), 

            (r'(algorithm|annotation|break|connect|constant|constrainedby|der|' 

             r'discrete|each|else|elseif|elsewhen|encapsulated|enumeration|' 

             r'equation|exit|expandable|extends|external|final|flow|for|if|' 

             r'import|impure|in|initial|inner|input|loop|nondiscrete|outer|' 

             r'output|parameter|partial|protected|public|pure|redeclare|' 

             r'replaceable|return|stream|then|when|while)\b', 

             Keyword.Reserved), 

            (r'(and|not|or)\b', Operator.Word), 

            (r'(block|class|connector|end|function|model|operator|package|' 

             r'record|type)\b', Keyword.Reserved, 'class'), 

            (r'(false|true)\b', Keyword.Constant), 

            (r'within\b', Keyword.Reserved, 'package-prefix'), 

            (_name, Name) 

        ], 

        'class': [ 

            include('whitespace'), 

            (r'(function|record)\b', Keyword.Reserved), 

            (r'(if|for|when|while)\b', Keyword.Reserved, '#pop'), 

            (_name, Name.Class, '#pop'), 

            default('#pop') 

        ], 

        'package-prefix': [ 

            include('whitespace'), 

            (_name, Name.Namespace, '#pop'), 

            default('#pop') 

        ], 

        'string': [ 

            (r'"', String.Double, '#pop'), 

            (r'\\[\'"?\\abfnrtv]', String.Escape), 

            (r'(?i)<\s*html\s*>([^\\"]|\\.)+?(<\s*/\s*html\s*>|(?="))', 

             using(HtmlLexer)), 

            (r'<|\\?[^"\\<]+', String.Double) 

        ] 

    } 

 

 

class BugsLexer(RegexLexer): 

    """ 

    Pygments Lexer for `OpenBugs <http://www.openbugs.net/>`_ and WinBugs 

    models. 

 

    .. versionadded:: 1.6 

    """ 

 

    name = 'BUGS' 

    aliases = ['bugs', 'winbugs', 'openbugs'] 

    filenames = ['*.bug'] 

 

    _FUNCTIONS = ( 

        # Scalar functions 

        'abs', 'arccos', 'arccosh', 'arcsin', 'arcsinh', 'arctan', 'arctanh', 

        'cloglog', 'cos', 'cosh', 'cumulative', 'cut', 'density', 'deviance', 

        'equals', 'expr', 'gammap', 'ilogit', 'icloglog', 'integral', 'log', 

        'logfact', 'loggam', 'logit', 'max', 'min', 'phi', 'post.p.value', 

        'pow', 'prior.p.value', 'probit', 'replicate.post', 'replicate.prior', 

        'round', 'sin', 'sinh', 'solution', 'sqrt', 'step', 'tan', 'tanh', 

        'trunc', 

        # Vector functions 

        'inprod', 'interp.lin', 'inverse', 'logdet', 'mean', 'eigen.vals', 

        'ode', 'prod', 'p.valueM', 'rank', 'ranked', 'replicate.postM', 

        'sd', 'sort', 'sum', 

        # Special 

        'D', 'I', 'F', 'T', 'C') 

    """ OpenBUGS built-in functions 

 

    From http://www.openbugs.info/Manuals/ModelSpecification.html#ContentsAII 

 

    This also includes 

 

    - T, C, I : Truncation and censoring. 

      ``T`` and ``C`` are in OpenBUGS. ``I`` in WinBUGS. 

    - D : ODE 

    - F : Functional http://www.openbugs.info/Examples/Functionals.html 

 

    """ 

 

    _DISTRIBUTIONS = ('dbern', 'dbin', 'dcat', 'dnegbin', 'dpois', 

                      'dhyper', 'dbeta', 'dchisqr', 'ddexp', 'dexp', 

                      'dflat', 'dgamma', 'dgev', 'df', 'dggamma', 'dgpar', 

                      'dloglik', 'dlnorm', 'dlogis', 'dnorm', 'dpar', 

                      'dt', 'dunif', 'dweib', 'dmulti', 'ddirch', 'dmnorm', 

                      'dmt', 'dwish') 

    """ OpenBUGS built-in distributions 

 

    Functions from 

    http://www.openbugs.info/Manuals/ModelSpecification.html#ContentsAI 

    """ 

 

    tokens = { 

        'whitespace': [ 

            (r"\s+", Text), 

        ], 

        'comments': [ 

            # Comments 

            (r'#.*$', Comment.Single), 

        ], 

        'root': [ 

            # Comments 

            include('comments'), 

            include('whitespace'), 

            # Block start 

            (r'(model)(\s+)(\{)', 

             bygroups(Keyword.Namespace, Text, Punctuation)), 

            # Reserved Words 

            (r'(for|in)(?![\w.])', Keyword.Reserved), 

            # Built-in Functions 

            (r'(%s)(?=\s*\()' 

             % r'|'.join(_FUNCTIONS + _DISTRIBUTIONS), 

             Name.Builtin), 

            # Regular variable names 

            (r'[A-Za-z][\w.]*', Name), 

            # Number Literals 

            (r'[-+]?[0-9]*\.?[0-9]+([eE][-+]?[0-9]+)?', Number), 

            # Punctuation 

            (r'\[|\]|\(|\)|:|,|;', Punctuation), 

            # Assignment operators 

            # SLexer makes these tokens Operators. 

            (r'<-|~', Operator), 

            # Infix and prefix operators 

            (r'\+|-|\*|/', Operator), 

            # Block 

            (r'[{}]', Punctuation), 

        ] 

    } 

 

    def analyse_text(text): 

        if re.search(r"^\s*model\s*{", text, re.M): 

            return 0.7 

        else: 

            return 0.0 

 

 

class JagsLexer(RegexLexer): 

    """ 

    Pygments Lexer for JAGS. 

 

    .. versionadded:: 1.6 

    """ 

 

    name = 'JAGS' 

    aliases = ['jags'] 

    filenames = ['*.jag', '*.bug'] 

 

    # JAGS 

    _FUNCTIONS = ( 

        'abs', 'arccos', 'arccosh', 'arcsin', 'arcsinh', 'arctan', 'arctanh', 

        'cos', 'cosh', 'cloglog', 

        'equals', 'exp', 'icloglog', 'ifelse', 'ilogit', 'log', 'logfact', 

        'loggam', 'logit', 'phi', 'pow', 'probit', 'round', 'sin', 'sinh', 

        'sqrt', 'step', 'tan', 'tanh', 'trunc', 'inprod', 'interp.lin', 

        'logdet', 'max', 'mean', 'min', 'prod', 'sum', 'sd', 'inverse', 

        'rank', 'sort', 't', 'acos', 'acosh', 'asin', 'asinh', 'atan', 

        # Truncation/Censoring (should I include) 

        'T', 'I') 

    # Distributions with density, probability and quartile functions 

    _DISTRIBUTIONS = tuple('[dpq]%s' % x for x in 

                           ('bern', 'beta', 'dchiqsqr', 'ddexp', 'dexp', 

                            'df', 'gamma', 'gen.gamma', 'logis', 'lnorm', 

                            'negbin', 'nchisqr', 'norm', 'par', 'pois', 'weib')) 

    # Other distributions without density and probability 

    _OTHER_DISTRIBUTIONS = ( 

        'dt', 'dunif', 'dbetabin', 'dbern', 'dbin', 'dcat', 'dhyper', 

        'ddirch', 'dmnorm', 'dwish', 'dmt', 'dmulti', 'dbinom', 'dchisq', 

        'dnbinom', 'dweibull', 'ddirich') 

 

    tokens = { 

        'whitespace': [ 

            (r"\s+", Text), 

        ], 

        'names': [ 

            # Regular variable names 

            (r'[a-zA-Z][\w.]*\b', Name), 

        ], 

        'comments': [ 

            # do not use stateful comments 

            (r'(?s)/\*.*?\*/', Comment.Multiline), 

            # Comments 

            (r'#.*$', Comment.Single), 

        ], 

        'root': [ 

            # Comments 

            include('comments'), 

            include('whitespace'), 

            # Block start 

            (r'(model|data)(\s+)(\{)', 

             bygroups(Keyword.Namespace, Text, Punctuation)), 

            (r'var(?![\w.])', Keyword.Declaration), 

            # Reserved Words 

            (r'(for|in)(?![\w.])', Keyword.Reserved), 

            # Builtins 

            # Need to use lookahead because . is a valid char 

            (r'(%s)(?=\s*\()' % r'|'.join(_FUNCTIONS 

                                          + _DISTRIBUTIONS 

                                          + _OTHER_DISTRIBUTIONS), 

             Name.Builtin), 

            # Names 

            include('names'), 

            # Number Literals 

            (r'[-+]?[0-9]*\.?[0-9]+([eE][-+]?[0-9]+)?', Number), 

            (r'\[|\]|\(|\)|:|,|;', Punctuation), 

            # Assignment operators 

            (r'<-|~', Operator), 

            # # JAGS includes many more than OpenBUGS 

            (r'\+|-|\*|\/|\|\|[&]{2}|[<>=]=?|\^|%.*?%', Operator), 

            (r'[{}]', Punctuation), 

        ] 

    } 

 

    def analyse_text(text): 

        if re.search(r'^\s*model\s*\{', text, re.M): 

            if re.search(r'^\s*data\s*\{', text, re.M): 

                return 0.9 

            elif re.search(r'^\s*var', text, re.M): 

                return 0.9 

            else: 

                return 0.3 

        else: 

            return 0 

 

 

class StanLexer(RegexLexer): 

    """Pygments Lexer for Stan models. 

 

    The Stan modeling language is specified in the *Stan Modeling Language 

    User's Guide and Reference Manual, v2.4.0*, 

    `pdf <https://github.com/stan-dev/stan/releases/download/v2.4.0/stan-reference-2.4.0.pdf>`__. 

 

    .. versionadded:: 1.6 

    """ 

 

    name = 'Stan' 

    aliases = ['stan'] 

    filenames = ['*.stan'] 

 

    tokens = { 

        'whitespace': [ 

            (r"\s+", Text), 

        ], 

        'comments': [ 

            (r'(?s)/\*.*?\*/', Comment.Multiline), 

            # Comments 

            (r'(//|#).*$', Comment.Single), 

        ], 

        'root': [ 

            # Stan is more restrictive on strings than this regex 

            (r'"[^"]*"', String), 

            # Comments 

            include('comments'), 

            # block start 

            include('whitespace'), 

            # Block start 

            (r'(%s)(\s*)(\{)' % 

             r'|'.join(('functions', 'data', r'transformed\s+?data', 

                        'parameters', r'transformed\s+parameters', 

                        'model', r'generated\s+quantities')), 

             bygroups(Keyword.Namespace, Text, Punctuation)), 

            # Reserved Words 

            (r'(%s)\b' % r'|'.join(_stan_builtins.KEYWORDS), Keyword), 

            # Truncation 

            (r'T(?=\s*\[)', Keyword), 

            # Data types 

            (r'(%s)\b' % r'|'.join(_stan_builtins.TYPES), Keyword.Type), 

            # Punctuation 

            (r"[;:,\[\]()]", Punctuation), 

            # Builtin 

            (r'(%s)(?=\s*\()' 

             % r'|'.join(_stan_builtins.FUNCTIONS 

                         + _stan_builtins.DISTRIBUTIONS), 

             Name.Builtin), 

            # Special names ending in __, like lp__ 

            (r'[A-Za-z]\w*__\b', Name.Builtin.Pseudo), 

            (r'(%s)\b' % r'|'.join(_stan_builtins.RESERVED), Keyword.Reserved), 

            # Regular variable names 

            (r'[A-Za-z]\w*\b', Name), 

            # Real Literals 

            (r'-?[0-9]+(\.[0-9]+)?[eE]-?[0-9]+', Number.Float), 

            (r'-?[0-9]*\.[0-9]*', Number.Float), 

            # Integer Literals 

            (r'-?[0-9]+', Number.Integer), 

            # Assignment operators 

            # SLexer makes these tokens Operators. 

            (r'<-|~', Operator), 

            # Infix, prefix and postfix operators (and = ) 

            (r"\+|-|\.?\*|\.?/|\\|'|\^|==?|!=?|<=?|>=?|\|\||&&", Operator), 

            # Block delimiters 

            (r'[{}]', Punctuation), 

        ] 

    } 

 

    def analyse_text(text): 

        if re.search(r'^\s*parameters\s*\{', text, re.M): 

            return 1.0 

        else: 

            return 0.0